データダウンロードガイド

SNP検索結果

SNP検索結果の表示項目を選択できるようにしました。また、表示された検索結果をCSV形式でダウンロードできるようにしました。

Dump JSNP®

Dump JSNP® は、SNPや遺伝子の特徴から絞込みをすることができ、得られた結果を選択した必要なデータとともに、各種データ形式でダウンロードすることができます。

    使い方:SNPデータ を絞り込み、ダウンロードできます。
    使い方:遺伝子データ を絞り込み、その遺伝子中と周辺の存在するSNP情報をダウンロードできます。

JSNP® data FASTA files

多型情報(SNPsとindel)とそれぞれ前後配列を FASTA 形式で提供しています。アレル頻度情報はテキスト形式で提供しています。

XML files

多型情報に関するXML ファイルの公開を始めました。格納されているデータは、Allele Sequence、Allele Frequency、 Mapping Information、Screened Sequence、PCR profile、Method です。

Genotype頻度データ

アクセスには、申請が必要です。

Control (Illumina:JSNP550typed)

Case (Perlegen)

    35疾患の日本人患者集団それぞれ191-195人分のDNAサンプルから得られた遺伝子型頻度情報です。それぞれのデータセットは常染色体上に存在するおよそ20万SNPsの遺伝子型頻度情報を収録しています。