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2013-03-27第41回公開 197,195 SNPs うち、84,651 SNPsにアレル頻度解析データがあります。第41回公開
2013年03月27日 第41回公開 197,195 SNPs うち、84,651 SNPsにアレル頻度解析データがあります。統合マップは、NCBIのヒトゲノム build 104 および Ensembl Human release 70,dbSNP build 137のrs情報に基づいています。
2013-03-27統合マップブラウザではNCBI build 104、Ensembl Human release 70、dbSNP build 137 のデータに基づいたデータを提供しています。第41回公開
統合マップブラウザではNCBI build 104、Ensembl Human release 70、dbSNP build 137のデータに基づいたデータを提供しています。
2013-03-27"疾患/形質関連SNPリスト"を更新しました。第41回公開
NHGRI "A Catalog of Published Genome-Wide Association Studies" を更新しました(2013-02-28時点)。
2012-04-04第40回公開 197,195 SNPs うち、84,651 SNPsにアレル頻度解析データがあります。第40回公開
2012年03月28日 第40回公開 197,195 SNPs うち、84,651 SNPsにアレル頻度解析データがあります。統合マップは、NCBIのヒトゲノム build 37 version 3および Ensembl Human release 65,dbSNP build 135のrs情報に基づいています。
2012-04-04統合マップブラウザではNCBI build37 version3、Ensembl Human release 65、dbSNP build 135のデータに基づいたデータを提供しています。第40回公開
2012-04-04"疾患/形質関連SNPリスト"を更新しました。第40回公開
NHGRI "A Catalog of Published Genome-Wide Association Studies" を更新しました(2012-02-29時点)。
2011-10-14第39回公開 197,195 SNPs うち、84,651 SNPsにアレル頻度解析データがあります。第39回公開
2011年10月14日 第39回公開 197,195 SNPs うち、84,651 SNPsにアレル頻度解析データがあります。統合マップは、NCBIのヒトゲノム build 37 version 2および Ensembl Human release 63,dbSNP build 134のrs情報に基づいています。
2011-10-14統合マップブラウザではNCBI build37 version2、Ensembl Human release 63、dbSNP build 134のデータに基づいたデータを提供しています。第39回公開
2011-10-14"疾患/形質関連SNPリスト"を更新しました。第39回公開
NHGRI "A Catalog of Published Genome-Wide Association Studies" を更新しました(2011-09-28時点)。
2010-10-18第38回公開 197,195 SNPs うち、84,651 SNPsにアレル頻度解析データがあります。第38回公開
2010年10月18日 第38回公開 197,195 SNPs うち、84,651 SNPsにアレル頻度解析データがあります。統合マップは、NCBIのヒトゲノム build 37 version 1および Ensembl Human release 59,dbSNP build 131のrs情報に基づいています。
2010-10-18統合マップブラウザではNCBI build37 version1、Ensembl Human release 59、dbSNP build 131のデータに基づいたデータを提供しています。第38回公開
2010-10-18"疾患/形質関連SNPリスト"を更新しました。第38回公開
NHGRI "A Catalog of Published Genome-Wide Association Studies" を更新しました(2010-09-22時点)。
2010-05-10"疾患/形質関連SNPリスト"を更新しました。第37_2回公開
JST "List of Published SNP-trait association studies by the Center for Genomic Medicine of RIKEN or other institutes"を新たに追加しました。 日本語訳とJSNP_IDを追加しています。 2010年3月4日にPubMedを検索し、理化学研究所遺伝子多型研究センター(現:ゲノム医科学研究センター)とその他の研究機関での研究を2002年以降に発行されたものに制限して抽出しています。これらの研究機関のSNPと疾患との関係研究全てを網羅しているわけではありません。
2010-05-10"疾患/形質関連SNPリスト"を更新しました。第37_2回公開
NHGRI "A Catalog of Published Genome-Wide Association Studies" を更新しました(2010-04-15時点)。
2009-11-26第37回公開 197,195 SNPs うち、84,651 SNPsにアレル頻度解析データがあります。第37回公開
2009年11月26日 第37回公開 197,195 SNPs うち、84,651 SNPsにアレル頻度解析データがあります。統合マップは、NCBIのヒトゲノム build 37 version 1および Ensembl Human release 56,dbSNP build 130のrs情報に基づいています。
2009-11-26統合マップブラウザではNCBI build37 version1、Ensembl Human release 56のデータに基づいたデータを提供しています。第37回公開
2009-11-26"SNP探索時のXMLファイル"を更新しました。第37回公開
SNP探索時の情報に基づくXMLファイルおよびSNP探索時のプライマー設計に用いたPCR領域に関するXMLファイルを更新しました。
2009-11-26"疾患/形質関連SNPリスト"を更新しました。第37回公開
NHGRI "A Catalog of Published Genome-Wide Association Studies" を更新しました(2009-10-30時点)。
2009-08-11第36回公開 197,195 SNPs うち、84,651 SNPsにアレル頻度解析データがあります。第36回公開
2009年8月11日 第36回公開 197,195 SNPs うち、84,651 SNPsにアレル頻度解析データがあります。統合マップは、NCBIのヒトゲノム build 36 version 3および Ensembl Human release 54,dbSNP build 130のrs情報に基づいています。
2009-08-11統合マップブラウザではNCBI build36 version3、Ensembl Human release 54のデータに基づいたデータを提供しています。第36回公開
2009-08-11rs情報やアレル頻度情報はdbSNP build 130に合わせ、更新しました。第36回公開
2009-08-11"疾患/形質関連SNPリスト"を更新しました。第36回公開
2009-07-23食道癌患者集団の遺伝子型頻度データセットを公開しました。お知らせ
2009-07-01サイトデザインを一新しました。第35_2回公開
2009-07-01"タグSNP検索" 機能を公開しました。第35_2回公開
"タグSNP検索" 機能では、従来のJSNP収録SNPとGenotype頻度データで提供しているSNPとを検索することができます。なお、これはdbSNPのrsID情報に基づいています。"タグSNP検索" 機能はホームページの検索窓と詳細検索サイトから利用できます。
2009-07-01"疾患/形質関連SNPリスト"を公開しました。第35_2回公開
NHGRI “A Catalog of Published Genome-Wide Association Studies” に日本語訳とJSNP_IDを追加しています。
2009-07-01"英語版遺伝子型頻度データセットアクセスページ" を公開しました。第35_2回公開
2009-01-07遺伝子型頻度データセットアクセスページを公開しました。お知らせ
2008-10-28第35回公開 197,195 SNPs うち、84,651 SNPsにアレル頻度解析データがあります。第35回公開
2008年10月28日 第35回公開 197,195 SNPs うち、84,651 SNPsにアレル頻度解析データがあります。統合マップは、NCBIのヒトゲノム build 36 version 3および Ensembl Human release 50,dbSNP build 129のrs情報に基づいています。
2008-10-28統合マップブラウザではNCBI build36 version3、Ensembl Human release 50のデータに基づいたデータを提供しています。第35回公開
2008-10-28rs情報やアレル頻度情報はdbSNP build 129に合わせ、更新しました。第35回公開
2008-07-07SNPが見つからなかった領域のSNP探索時のプライマー設計に用いたPCR領域に関するXMLファイルを公開しました。第34_2回公開
2008年7月7日 SNPが見つからなかった領域のSNP探索時のプライマー設計に用いたPCR領域に関するXMLファイルを公開しました。
2008-06-12第34回公開 35疾患の日本人患者集団の遺伝子型データセットを公開しました。第34回公開
これらのデータセットは35疾患の日本人患者集団それぞれ191-195人分のDNAサンプルから得られた遺伝子型頻度情報です。それぞれのデータセットは常染色体上に存在するおよそ20万SNPsの遺伝子型頻度情報を収録しています。なお、個人別の遺伝子型情報は含んでいません。遺伝子型決定は Perlegen Sciences社が実施し、理化学研究所ゲノム医科学研究センター(旧:遺伝子多型研究センター)および東京大学医科学研究所の共同研究により行われました。35疾患の患者集団のサンプルはオーダーメイド医療実現化プロジェクト(the Biobank Japan)により収集されました。
2008-04-21第33回公開 197,195 SNPs うち、84,651 SNPsにアレル頻度解析データがあります。第33回公開
2008年4月21日 第33回公開 197,195 SNPs うち、84,651 SNPsにアレル頻度解析データがあります。統合マップは、NCBIのヒトゲノム build 36 version 3および Ensembl Human release 49,dbSNP build 128のrs情報に基づいています。
2008-04-21理化学研究所遺伝子多型研究センターより5SNPの情報が追加されました。第33回公開
2008-04-21遺伝子SCG3の遺伝子型情報を追加しました。第33回公開
2008-04-21統合マップブラウザではNCBI build36 version3、Ensembl Human release49のデータに基づいたデータを提供しています。第33回公開
2008-04-21rs情報やアレル頻度情報はdbSNP build 128に合わせ、更新しました。第33回公開
2008-04-21"Dump JSNP with XQuery"のサービスは終了しました。第33回公開
2007-12-20日本人一般集団934人におけ515,286カ所のSNPの遺伝子型頻度データセット(JSNP550typed)のダウンロードサイトを公開しました。第32_2回公開
2007年12月20日 日本人一般集団934人におけ515,286カ所のSNPの遺伝子型頻度データセット(JSNP550typed)のダウンロードサイトを公開しました。
2007-10-31 第32回公開 日本人一般集団934人における515,286カ所のSNPの遺伝子型頻度データをJSNP550typedとして公開しました。第32回公開
このデータセットは、理化学研究所遺伝子多型研究センター(現:ゲノム医科学研究センター)および東京大学医科学研究所より国内外の研究者に広く公開する目的で提供されました。試料収集、遺伝子型決定(genotyping)、バイオインフォマティクス、データの品質管理は、両機関の共同研究により行われました。公開される情報は、イルミナ社製ビーズアレイ技術により作成されたDNAチップ(HumanHap550K)により解析されております。解析されたデータは種々の閾値により選別され、最終的に常染色体上の515,286カ所のSNPの頻度情報を公開しています。
2007-10-31統合マップ(Integrated Maps)ブラウザにJSNP550typedのトラックを追加しました。第32回公開
2007-06-252007年6月25日 第31回公開 197,157 SNPs うち、84,618 SNPsにアレル頻度解析データがあります。第31回公開
2007年6月25日 第31回公開 197,157 SNPs うち、84,618 SNPsにアレル頻度解析データがあります。統合マップは、NCBIのヒトゲノム build 36 version 2および Ensembl Human release 44,dbSNP build 127のrs情報に基づいています。
2007-06-25理化学研究所遺伝子多型研究センターより6SNPのアレル頻度情報が追加されました。第31回公開
2007-06-25rs情報やアレル頻度情報はdbSNP build 127に合わせ、更新しました。第31回公開
2007-06-25遺伝子単位の検索結果表示には、多型情報のハブ機能となるように12の多型関連情報データベースへのリンク情報が含まれています。第31回公開
2007-01-11第30回公開 197,157 SNPs うち、84,612 SNPsにアレル頻度解析データがあります。第30回公開
2007年1月11日 第30回公開 197,157 SNPs うち、84,612 SNPsにアレル頻度解析データがあります。統合マップは、NCBIのヒトゲノム build 36 version 2、dbSNP build126のrs情報に基づいています。
2007-01-11トップページから遺伝子検索ができるようになりました。第30回公開
2006-09-05第29回公開 197,157 SNPs うち、84,612 SNPsにアレル頻度解析データがあります。第29回公開
2006-09-05OMIM の phenotyepe ID へのリンクを追加しました。 第29回公開
2006-09-05遺伝子単位の検索結果表示にDrugBank(http://redpoll.pharmacy.ualberta.ca/drugbank/)へのリンク情報を追加しました。第29回公開
2006-09-05各遺伝子構造中の塩基置換型の頻度の統計が染色体別にご覧いただけます。第29回公開
2006-05-30第28回公開 197,157 SNPs うち、84,612 SNPsにアレル頻度解析データがあります。第28回公開
2006年5月30日 第28回公開 197,157 SNPs うち、84,612 SNPsにアレル頻度解析データがあります。統合マップは、NCBIのヒトゲノム build 36 version 1、dbSNP build125のrs情報に基づいています。
2006-05-30理化学研究所 横浜研究所 遺伝子多型研究センターから新規SNPの登録がありました。第28回公開
2006-05-30RSSフィードの配信を開始しました。第28回公開
RSSフィードの配信を開始しました。RSSフィードからJSNPの新着情報が入手できます。
2006-05-30JSNPへのリンク用アイコンをご用意いたしました。第28回公開
2006-05-30PML形式による"Dump JSNP with XQuery"の提供を試験的に開始しました。 第28回公開
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2013-03-27The 41th data release consists of 197,195 SNPs ; 84,651 SNPs with allele frequency.release 41
Mar 27, 2013 The 41th data release consists of 197,195 SNPs ; 84,651 SNPs with allele frequency. The Integrated mapping information is based on NCBI's build 104, Ensembl Human release 70 and rs number of dbSNP build137.
2013-03-27The Integrated mapping information is based on NCBI's build 104, Ensembl Human release 70 and rs number of dbSNP build137.release 41
2013-03-27"List of SNP-trait associations" has been updated.release 41
NHGRI "A Catalog of Published Genome-Wide Association Studies" has been updated( accessed 2013-02-28 ).
2012-04-04The 40th data release consists of 197,195 SNPs ; 84,651 SNPs with allele frequency.release 40
Mar 28, 2012 The 40th data release consists of 197,195 SNPs ; 84,651 SNPs with allele frequency. The Integrated mapping information is based on NCBI's build 37 version 3, Ensembl Human release 65 and rs number of dbSNP build135.
2012-04-04The Integrated mapping information is based on NCBI's build 37 version 3, Ensembl Human release 65 and rs number of dbSNP build135.release 40
2012-04-04"List of SNP-trait associations" has been updated.release 40
NHGRI "A Catalog of Published Genome-Wide Association Studies" has been updated( accessed 2012-02-29 ).
2011-10-14The 39th data release consists of 197,195 SNPs ; 84,651 SNPs with allele frequency.release 39
Oct 14, 2011 The 39th data release consists of 197,195 SNPs ; 84,651 SNPs with allele frequency. The Integrated mapping information is based on NCBI's build 37 version 2, Ensembl Human release 63 and rs number of dbSNP build134.
2011-10-14The Integrated mapping information is based on NCBI's build 37 version 2, Ensembl Human release 63 and rs number of dbSNP build134.release 39
2011-10-14"List of SNP-trait associations" has been updated.release 39
NHGRI "A Catalog of Published Genome-Wide Association Studies" has been updated( accessed 2011-09-28 ).
2010-10-18The 38th data release consists of 197,195 SNPs ; 84,651 SNPs with allele frequency.release 38
Oct 18, 2010 The 38th data release consists of 197,195 SNPs ; 84,651 SNPs with allele frequency. The Integrated mapping information is based on NCBI's build 37 version 1, Ensembl Human release 59 and rs number of dbSNP build131.
2010-10-18The Integrated mapping information is based on NCBI's build 37 version 1, Ensembl Human release 59 and rs number of dbSNP build131.release 38
2010-10-18"List of SNP-trait associations" has been updated.release 38
NHGRI "A Catalog of Published Genome-Wide Association Studies" has been updated( accessed 2010-09-22 ).
2010-05-10"List of SNP-trait associations" has been updated.release 37_2
JST "List of Published SNP-trait association studies by the Center for Genomic Medicine of RIKEN or other institutes" has been added as new data resources. Disease and traits are translated in Japanese and JSNP_ID are added. Studies were identified through PubMed literature searches on March 4, 2010 which were limited after publication year 2002. And so these aren't all studies for SNP-trait association by the Center for Genomic Medicine of RIKEN (previously known as the SNP Research Center of RIKEN) or other institutes.
2010-05-10"List of SNP-trait associations" has been updated.release 37_2
NHGRI "A Catalog of Published Genome-Wide Association Studies" has been updated( accessed 2010-04-15 ).
2009-11-26The 37th data release consists of 197,195 SNPs ; 84,651 SNPs with allele frequency.release 37
Nov 26, 2009 The 37th data release consists of 197,195 SNPs ; 84,651 SNPs with allele frequency. The Integrated mapping information is based on NCBI's build 37 version 1, Ensembl Human release 56 and rs number of dbSNP build130.
2009-11-26The Integrated mapping information is based on NCBI's build 37 version 1, Ensembl Human release 56 and rs number of dbSNP build130.release 37
2009-11-26"XML Files" have been updated.release 37
XML files based on Screened information and XML files for data related to PCR region for primer design have been updated.
2009-11-26"List of SNP-trait associations" has been updated.release 37
NHGRI "A Catalog of Published Genome-Wide Association Studies" has been updated( accessed 2009-10-30 ).
2009-08-11The 36th data release consists of 197,195 SNPs ; 84,651 SNPs with allele frequency.release 36
Aug 11, 2009 The 36th data release consists of 197,195 SNPs ; 84,651 SNPs with allele frequency. The Integrated mapping information is based on NCBI's build 36 version 3, Ensembl Human release 54 and rs number of dbSNP build130.
2009-08-11The Integrated mapping information is based on NCBI's build 36 version 3, Ensembl Human release 54 and rs number of dbSNP build130.release 36
2009-08-11The rs number and the allele frequency information according to NCBI's dbSNP build 130 have been available.release 36
2009-08-11"List of SNP-trait associations" has been updated.release 36
2009-07-23New genotype frequency dataset of esophageal cancer study has been released.announcement
2009-07-01New design website has been released.release 35-2
2009-07-01"Search Tag SNP" has been released.release 35-2
"Search Tag SNP"is available for searching JSNP original SNPs and SNPs with Genotype Summary Data based on dbSNP ID(rs#). "Search Tag SNP"is available on the HOME site and its advanced search site.
2009-07-01"List of SNP-trait associations" has been released.release 35-2
Data resource is NHGRI "A Catalog of Published Genome-Wide Association Studies". Disease and traits are translated in Japanese and JSNP_ID are added.
2009-07-01"Genotype Summary Data Access"page has been opened.release 35-2
2008-10-28The 35th data release consists of 197,195 SNPs ; 84,651 SNPs with allele frequency.release 35
Oct 28, 2008 The 35th data release consists of 197,195 SNPs ; 84,651 SNPs with allele frequency. The Integrated mapping information is based on NCBI's build 36 version 3, Ensembl Human release 50 and rs number of dbSNP build129.
2008-10-28The Integrated mapping information is based on NCBI's build 36 version 3, Ensembl Human release 50 and rs number of dbSNP build129.release 35
2008-10-28The rs number and the allele frequency information according to NCBI's dbSNP build 129 have been available.release 35
2008-07-07XML files of data related to PCR region for primer design where no genetic variations were discovered have been released.release 34_2
2008-07-07  XML files of data related to PCR region for primer design where no genetic variations were discovered have been released.
2008-06-12The 34th data release consists of genotypic datasets with 35 diseases.release 34
These datasets are the genotypic data of 191-195 Japanese samples from each of 35 diseases. Each dataset provides almost 200,000 SNPs in autosomal chromosomes with genotyping information without individual genotype data. The genotyping was performed by Perlegen Sciences, Inc. in collaboration with the Center for Genomic Medicine of RIKEN (previously known as the SNP Research Center of RIKEN) and the University of Tokyo. These samples come from The Biobank Japan project on the implementation of personalized medicine.
2008-04-21The 33rd data release consists of 197,195 SNPs ; 84,651 SNPs with allele frequency.release 33
April 21, 2008 The 33rd data release consists of 197,195 SNPs ; 84,651 SNPs with allele frequency. The Integrated mapping information is based on NCBI's build 36 version 3, Ensembl Human release 49 and rs number of dbSNP build128.
2008-04-215 allele data by the SNP Research Center, RIKEN have been added.release 33
2008-04-21SCG3 gene polymorphisms with genotype frequency information have been added,release 33
2008-04-21The Integrated mapping information is based on NCBI's build 36 version 3, Ensembl Human release 49 and rs number of dbSNP build128.release 33
2008-04-21The rs number and the allele frequency information according to NCBI's dbSNP build 128 have been available.release 33
2008-04-21"Dump JSNP with XQuery" has been closed.release 33
2007-12-20Download JSNP550typed site has been available to get the dataset of 515,286 SNPs with genotyping information participated by 934 Japanese volunteers.release 32_2
Dec 20, 2007 Download JSNP550typed site has been available to get the dataset of 515,286 SNPs with genotyping information participated by 934 Japanese volunteers.
2007-10-31The 32nd data release is the special dataset release of 515,286 SNPs with genotyping information participated by 934 Japanese volunteers. We call this dataset JSNP550typed.release 32
The sample collection, genotyping, bioinformatics and data quality control have been performed in collaboration with the SNP Research Center of RIKEN and the University of Tokyo. JSNP550typed provides data of 515,286 SNPs in autosomal chromosomes with genotyping information and annotation without individual genotype data. Genotyping was performed using the Illumina HumanHap550 BeadChip and quality control filters were applied.
2007-10-31Integrated Maps provide a new track for JSNP550typed.release 32
2007-06-25The 31st data release consists of 197,157 SNPs ; 84,618 SNPs with allele frequency.release 31
June 25, 2007 The 31st data release consists of 197,157 SNPs ; 84,618 SNPs with allele frequency. The Integrated mapping information is based on NCBI's build 36 version 2, Ensembl Human release 44 and rs number of dbSNP build127.
2007-06-256 allele frequency data by the SNP Research Center, RIKEN have been added.release 31
2007-06-25The rs number and the allele frequency information according to NCBI's dbSNP build 127 have been availablerelease 31
2007-06-25The Locus Information has links to related mutation databases.release 31
2007-01-11The 30th data release consists of 197,157 SNPs ; 84,612 SNPs with allele frequency.release 30
January 11, 2007 The 30th data release consists of 197,157 SNPs ; 84,612 SNPs with allele frequency. The Integrated mapping information is based on NCBI's build 36 version 2 and rs number of dbSNP build126.
2007-01-11'Search Gene' is available on the home page.release 30
2006-09-05The 29th data release consists of 197,157 SNPs ; 84,612 SNPs with allele frequency.release 29
Sep 5, 2006 The 29th data release consists of 197,157 SNPs ; 84,612 SNPs with allele frequency. The Integrated mapping information is based on NCBI's build 36 version 1 and rs number of dbSNP build126.
2006-09-05Links to related OMIM phenotype ID have been added. release 29
2006-09-05The Locus Information has links to the DrugBank database (http://redpoll.pharmacy.ualberta.ca/drugbank/) and it is available to search using "Generic Name" of the drug.release 29
2006-09-05Types of variations found in location in gene are shown by chromosome.release 29
2006-05-30The 28th data release consists of 197,157 SNPs ; 84,612 SNPs with allele frequency. release 28
May 30, 2006 The 28th data release consists of 197,157 SNPs ; 84,612 SNPs with allele frequency. The Integrated mapping information is based on NCBI's build 36 version 1 and rs number of dbSNP build125.
2006-05-30The SNPs discovered by the SNP Research Center, the Institute of Physical and Chemical Research (RIKEN) have been available to search and added in the ftp files. release 28
2006-05-30We have started offering RSS news feed. release 28
We have started offering RSS news feed. JSNP news and information is available through RSS feeds.
2006-05-30JSNP provides dedicated link icons for use when establishing a link from your web site to JSNP.release 28
2006-05-30We have launched "Dump JSNP with XQuery" on trial providing data according to PML. release 28