http://snp.ims.u-tokyo.ac.jp/jsnpnews_doc.html#rss JSNP 新着情報 http://snp.ims.u-tokyo.ac.jp/jsnpnews_doc.html#rss20120404-1 2012年03月28日 第40回公開 197,195 SNPs うち、84,651 SNPsにアレル頻度解析データがあります。統合マップは、NCBIのヒトゲノム build 37 version 3および Ensembl Human release 65,dbSNP build 135のrs情報に基づいています。 第40回公開 Wed,4 Apr 2012 13:00:00 +0900 20120404-1 2012-04-04 http://snp.ims.u-tokyo.ac.jp/jsnpnews_doc.html#rss20120404-2 第40回公開 Wed,4 Apr 2012 13:00:00 +0900 20120404-2 2012-04-04 http://snp.ims.u-tokyo.ac.jp/jsnpnews_doc.html#rss20120404-3 NHGRI "A Catalog of Published Genome-Wide Association Studies" を更新しました(2012-02-29時点)。 第40回公開 Wed,4 Apr 2012 13:00:00 +0900 20120404-3 2012-04-04 gwas_notes.html http://snp.ims.u-tokyo.ac.jp/jsnpnews_doc.html#rss20111014-1 2011年10月14日 第39回公開 197,195 SNPs うち、84,651 SNPsにアレル頻度解析データがあります。統合マップは、NCBIのヒトゲノム build 37 version 2および Ensembl Human release 63,dbSNP build 134のrs情報に基づいています。 第39回公開 Fri,14 Oct 2011 13:00:00 +0900 20111014-1 2011-10-14 http://snp.ims.u-tokyo.ac.jp/jsnpnews_doc.html#rss20111014-2 第39回公開 Fri,14 Oct 2011 13:00:00 +0900 20111014-2 2011-10-14 http://snp.ims.u-tokyo.ac.jp/jsnpnews_doc.html#rss20111014-3 NHGRI "A Catalog of Published Genome-Wide Association Studies" を更新しました(2011-09-28時点)。 第39回公開 Fri,14 Oct 2011 13:00:00 +0900 20111014-3 2011-10-14 gwas_notes.html http://snp.ims.u-tokyo.ac.jp/jsnpnews_doc.html#rss20101018-1 2010年10月18日 第38回公開 197,195 SNPs うち、84,651 SNPsにアレル頻度解析データがあります。統合マップは、NCBIのヒトゲノム build 37 version 1および Ensembl Human release 59,dbSNP build 131のrs情報に基づいています。 第38回公開 Mon,18 Oct 2010 13:00:00 +0900 20101018-1 2010-10-18 http://snp.ims.u-tokyo.ac.jp/jsnpnews_doc.html#rss20101018-2 第38回公開 Mon,18 Oct 2010 13:00:00 +0900 20101018-2 2010-10-18 http://snp.ims.u-tokyo.ac.jp/jsnpnews_doc.html#rss20101018-3 NHGRI "A Catalog of Published Genome-Wide Association Studies" を更新しました(2010-09-22時点)。 第38回公開 Mon,18 Oct 2010 13:00:00 +0900 20101018-3 2010-10-18 gwas_notes.html http://snp.ims.u-tokyo.ac.jp/jsnpnews_doc.html#rss20100510-1 JST "List of Published SNP-trait association studies by the Center for Genomic Medicine of RIKEN or other institutes"を新たに追加しました。 日本語訳とJSNP_IDを追加しています。 2010年3月4日にPubMedを検索し、理化学研究所遺伝子多型研究センター（現：ゲノム医科学研究センター）とその他の研究機関での研究を2002年以降に発行されたものに制限して抽出しています。これらの研究機関のSNPと疾患との関係研究全てを網羅しているわけではありません。 第37_2回公開 Mon,10 May 2010 13:00:00 +0900 20100510-1 2010-05-10 gwas_notes.html http://snp.ims.u-tokyo.ac.jp/jsnpnews_doc.html#rss20100510-2 NHGRI "A Catalog of Published Genome-Wide Association Studies" を更新しました(2010-04-15時点)。 第37_2回公開 Mon,10 May 2010 13:00:00 +0900 20100510-2 2010-05-10 gwas_notes.html http://snp.ims.u-tokyo.ac.jp/jsnpnews_doc.html#rss20091126-1 2009年11月26日 第37回公開 197,195 SNPs うち、84,651 SNPsにアレル頻度解析データがあります。統合マップは、NCBIのヒトゲノム build 37 version 1および Ensembl Human release 56,dbSNP build 130のrs情報に基づいています。 第37回公開 Thu,26 Nov 2009 13:00:00 +0900 20091126-1 2009-11-26 http://snp.ims.u-tokyo.ac.jp/jsnpnews_doc.html#rss20091126-2 第37回公開 Thu,26 Nov 2009 13:00:00 +0900 20091126-2 2009-11-26 http://snp.ims.u-tokyo.ac.jp/jsnpnews_doc.html#rss20091126-3 SNP探索時の情報に基づくXMLファイルおよびSNP探索時のプライマー設計に用いたPCR領域に関するXMLファイルを更新しました。 第37回公開 Thu,26 Nov 2009 13:00:00 +0900 20091126-3 2009-11-26 XML_ja.html http://snp.ims.u-tokyo.ac.jp/jsnpnews_doc.html#rss20091126-4 NHGRI "A Catalog of Published Genome-Wide Association Studies" を更新しました(2009-10-30時点)。 第37回公開 Thu,26 Nov 2009 13:00:00 +0900 20091126-4 2009-11-26 gwas_notes.html http://snp.ims.u-tokyo.ac.jp/index_ja.html#rss20090811-1 2009年8月11日 第36回公開 197,195 SNPs うち、84,651 SNPsにアレル頻度解析データがあります。統合マップは、NCBIのヒトゲノム build 36 version 3および Ensembl Human release 54,dbSNP build 130のrs情報に基づいています。 第36回公開 Tue,11 Aug 2009 13:00:00 +0900 20090811-1 2009-08-11 http://snp.ims.u-tokyo.ac.jp/index_ja.html#rss20090811-2 第36回公開 Tue,11 Aug 2009 13:00:00 +0900 20090811-2 2009-08-11 http://snp.ims.u-tokyo.ac.jp/index_ja.html#rss20090811-3 第36回公開 Tue,11 Aug 2009 13:00:00 +0900 20090811-3 2009-08-11 http://snp.ims.u-tokyo.ac.jp/index_ja.html#rss20090811-4 第36回公開 Tue,11 Aug 2009 13:00:00 +0900 20090811-4 2009-08-11 gwas_notes.html http://snp.ims.u-tokyo.ac.jp/jsnpnews_doc.html#rss20090723-1 お知らせ Thu,23 Jul 2009 13:00:00 +0900 20090723-1 2009-07-23 jsnp_gtype_access_jp.html http://snp.ims.u-tokyo.ac.jp/jsnpnews_doc.html#rss20090701-1 第35_2回公開 Wed,1 Jul 2009 13:00:00 +0900 20090701-1 2009-07-01 http://snp.ims.u-tokyo.ac.jp/jsnpnews_doc.html#rss20090701-2 "タグSNP検索" 機能では、従来のJSNP収録SNPとGenotype頻度データで提供しているSNPとを検索することができます。なお、これはdbSNPのrsID情報に基づいています。"タグSNP検索" 機能はホームページの検索窓と詳細検索サイトから利用できます。 第35_2回公開 Wed,1 Jul 2009 13:00:00 +0900 20090701-2 2009-07-01 cgi-bin/search_disp.cgi http://snp.ims.u-tokyo.ac.jp/jsnpnews_doc.html#rss20090701-3 NHGRI “A Catalog of Published Genome-Wide Association Studies” に日本語訳とJSNP_IDを追加しています。 第35_2回公開 Wed,1 Jul 2009 13:00:00 +0900 20090701-3 2009-07-01 gwas_notes.html http://snp.ims.u-tokyo.ac.jp/jsnpnews_doc.html#rss20090701-4 第35_2回公開 Wed,1 Jul 2009 13:00:00 +0900 20090701-4 2009-07-01 http://snp.ims.u-tokyo.ac.jp/jsnpnews_doc.html#rss20090107-1 お知らせ Wed,7 Jan 2009 13:00:00 +0900 20090107-1 2009-01-07 jsnp_gtype_access_jp.html http://snp.ims.u-tokyo.ac.jp/jsnpnews_doc.html#rss20081028-1 2008年10月28日 第35回公開 197,195 SNPs うち、84,651 SNPsにアレル頻度解析データがあります。統合マップは、NCBIのヒトゲノム build 36 version 3および Ensembl Human release 50,dbSNP build 129のrs情報に基づいています。 第35回公開 Tue,28 Oct 2008 13:00:00 +0900 20081028-1 2008-10-28 http://snp.ims.u-tokyo.ac.jp/jsnpnews_doc.html#rss20081028-2 第35回公開 Tue,28 Oct 2008 13:00:00 +0900 20081028-2 2008-10-28 http://snp.ims.u-tokyo.ac.jp/jsnpnews_doc.html#rss20081028-3 第35回公開 Tue,28 Oct 2008 13:00:00 +0900 20081028-3 2008-10-28 http://snp.ims.u-tokyo.ac.jp/jsnpnews_doc.html#rss20080707-1 2008年7月7日 SNPが見つからなかった領域のSNP探索時のプライマー設計に用いたPCR領域に関するXMLファイルを公開しました。 第34_2回公開 Mon,7 Jul 2008 13:00:00 +0900 20080707-1 2008-07-07 http://snp.ims.u-tokyo.ac.jp/jsnpnews_doc.html#rss20080612-1 これらのデータセットは35疾患の日本人患者集団それぞれ191-195人分のDNAサンプルから得られた遺伝子型頻度情報です。それぞれのデータセットは常染色体上に存在するおよそ20万SNPsの遺伝子型頻度情報を収録しています。なお、個人別の遺伝子型情報は含んでいません。遺伝子型決定は Perlegen Sciences社が実施し、理化学研究所ゲノム医科学研究センター(旧：遺伝子多型研究センター）および東京大学医科学研究所の共同研究により行われました。35疾患の患者集団のサンプルはオーダーメイド医療実現化プロジェクト（the Biobank Japan）により収集されました。 第34回公開 Thu,12 Jun 2008 13:00:00 +0900 20080612-1 2008-06-12 https://snp.jst.go.jp/genotype/Genotype_data_summary_JP.html http://snp.ims.u-tokyo.ac.jp/jsnpnews_doc.html#rss20080421-1 2008年4月21日 第33回公開 197,195 SNPs うち、84,651 SNPsにアレル頻度解析データがあります。統合マップは、NCBIのヒトゲノム build 36 version 3および Ensembl Human release 49,dbSNP build 128のrs情報に基づいています。 第33回公開 Mon,21 Apr 2008 13:00:00 +0900 20080421-1 2008-04-21 http://snp.ims.u-tokyo.ac.jp/jsnpnews_doc.html#rss20080421-2 第33回公開 Mon,21 Apr 2008 13:00:00 +0900 20080421-2 2008-04-21 http://snp.ims.u-tokyo.ac.jp/jsnpnews_doc.html#rss20080421-3 第33回公開 Mon,21 Apr 2008 13:00:00 +0900 20080421-3 2008-04-21 http://snp.ims.u-tokyo.ac.jp/jsnpnews_doc.html#rss20080421-4 第33回公開 Mon,21 Apr 2008 13:00:00 +0900 20080421-4 2008-04-21 http://snp.ims.u-tokyo.ac.jp/jsnpnews_doc.html#rss20080421-5 第33回公開 Mon,21 Apr 2008 13:00:00 +0900 20080421-5 2008-04-21 http://snp.ims.u-tokyo.ac.jp/jsnpnews_doc.html#rss20080421-6 第33回公開 Mon,21 Apr 2008 13:00:00 +0900 20080421-6 2008-04-21 http://snp.ims.u-tokyo.ac.jp/jsnpnews_doc.html#rss20071220-1 2007年12月20日 日本人一般集団934人におけ515,286カ所のSNPの遺伝子型頻度データセット（JSNP550typed）のダウンロードサイトを公開しました。 第32_2回公開 Thu,20 Dec 2007 13:00:00 +0900 20071220-1 2007-12-20 http://snp.ims.u-tokyo.ac.jp/jsnpnews_doc.html#rss20071031-1 このデータセットは、理化学研究所遺伝子多型研究センター（現：ゲノム医科学研究センター）および東京大学医科学研究所より国内外の研究者に広く公開する目的で提供されました。試料収集、遺伝子型決定(genotyping)、バイオインフォマティクス、データの品質管理は、両機関の共同研究により行われました。公開される情報は、イルミナ社製ビーズアレイ技術により作成されたDNAチップ（HumanHap550K）により解析されております。解析されたデータは種々の閾値により選別され、最終的に常染色体上の515,286カ所のSNPの頻度情報を公開しています。 第32回公開 Wed,31 Oct 2007 13:00:00 +0900 20071031-1 2007-10-31 JSNP550typed_summary_ja.html http://snp.ims.u-tokyo.ac.jp/jsnpnews_doc.html#rss20071031-2 第32回公開 Wed,31 Oct 2007 13:00:00 +0900 20071031-2 2007-10-31 http://snp.ims.u-tokyo.ac.jp/jsnpnews_doc.html#rss20070625-1 2007年6月25日 第31回公開 197,157 SNPs うち、84,618 SNPsにアレル頻度解析データがあります。統合マップは、NCBIのヒトゲノム build 36 version 2および Ensembl Human release 44,dbSNP build 127のrs情報に基づいています。 第31回公開 Mon,25 Jun 2007 13:00:00 +0900 20070625-1 2007-06-25 http://snp.ims.u-tokyo.ac.jp/jsnpnews_doc.html#rss20070625-2 第31回公開 Mon,25 Jun 2007 13:00:00 +0900 20070625-2 2007-06-25 http://snp.ims.u-tokyo.ac.jp/jsnpnews_doc.html#rss20070625-3 第31回公開 Mon,25 Jun 2007 13:00:00 +0900 20070625-3 2007-06-25 http://snp.ims.u-tokyo.ac.jp/jsnpnews_doc.html#rss20070625-4 第31回公開 Mon,25 Jun 2007 13:00:00 +0900 20070625-4 2007-06-25 http://snp.ims.u-tokyo.ac.jp/jsnpnews_doc.html#rss20070111-1 2007年1月11日 第30回公開 197,157 SNPs うち、84,612 SNPsにアレル頻度解析データがあります。統合マップは、NCBIのヒトゲノム build 36 version 2、dbSNP build126のrs情報に基づいています。 第30回公開 Thu,11 Jan 2007 13:00:00 +0900 20070111-1 2007-01-11 http://snp.ims.u-tokyo.ac.jp/jsnpnews_doc.html#rss20070111-2 第30回公開 Thu,11 Jan 2007 13:00:00 +0900 20070111-2 2007-01-11 http://snp.ims.u-tokyo.ac.jp/jsnpnews_doc.html#rss20060905-1 第29回公開 Tue,5 Sep 2006 13:00:00 +0900 20060905-1 2006-09-05 http://snp.ims.u-tokyo.ac.jp/jsnpnews_doc.html#rss20060905-2 第29回公開 Tue,5 Sep 2006 13:00:00 +0900 20060905-2 2006-09-05 http://snp.ims.u-tokyo.ac.jp/jsnpnews_doc.html#rss20060905-3 第29回公開 Tue,5 Sep 2006 13:00:00 +0900 20060905-3 2006-09-05 http://snp.ims.u-tokyo.ac.jp/jsnpnews_doc.html#rss20060905-4 第29回公開 Tue,5 Sep 2006 13:00:00 +0900 20060905-4 2006-09-05 http://snp.ims.u-tokyo.ac.jp/jsnpnews_doc.html#rss20060530-1 2006年5月30日 第28回公開 197,157 SNPs うち、84,612 SNPsにアレル頻度解析データがあります。統合マップは、NCBIのヒトゲノム build 36 version 1、dbSNP build125のrs情報に基づいています。 第28回公開 Tue,30 May 2006 13:00:00 +0900 20060530-1 2006-05-30 http://snp.ims.u-tokyo.ac.jp/jsnpnews_doc.html#rss20060530-2 第28回公開 Tue,30 May 2006 13:00:00 +0900 20060530-2 2006-05-30 http://snp.ims.u-tokyo.ac.jp/jsnpnews_doc.html#rss20060530-3 RSSフィードの配信を開始しました。RSSフィードからJSNPの新着情報が入手できます。 第28回公開 Tue,30 May 2006 13:00:00 +0900 20060530-3 2006-05-30 http://snp.ims.u-tokyo.ac.jp/jsnpnews_doc.html#rss20060530-4 第28回公開 Tue,30 May 2006 13:00:00 +0900 20060530-4 2006-05-30 http://snp.ims.u-tokyo.ac.jp/jsnpnews_doc.html#rss20060530-5 第28回公開 Tue,30 May 2006 13:00:00 +0900 20060530-5 2006-05-30